Paddington au Pérou raconte l’histoire de Paddington au Pérou alors qu’il revient rendre visite à sa tante bien-aimée Lucy, qui réside désormais à la maison des ours retraités. Avec la famille Brown à ses côtés, une aventure palpitante se déroule alors qu’un mystère les envoie dans un voyage inattendu à travers la forêt amazonienne et jusqu’aux sommets des montagnes du Pérou.